La carrière de Server commence en 2000 (une saison de football dans le championnat Ouzbek début fin février pour se terminer fin novmebre de la même année civile) alors qu'il vient a peine de fêter ses 17 ans, il signe son 1er contrat professionnel dans le club ouzbek du Navbahor Namangan, club basé dans la ville du même nom à la pointe Est de l'Ouzbekistan à 2 pas de le frontière du Kirghizistan.
Il passera 2 saisons sous les couleurs du Navbahor jouant 46 matchs, inscrivant 7 buts en terminant respectivement 5e et 4e du championnat Ouzbek en 2000 et 2001.
En 2002, il débarque dans un des nombreux club de la capitale Ouzbek, le Pakhtakor Tachkent. Sa carrière va alors pendre son envol, il va passer 6 saisons au sein du Pakhtakor, remportant 6 championnats et 6 coupe nationales, ce qui lui vaut d'être appelé, dès l'année 2002 en équipe nationale Ouzbek. Son bilan au au "Pakh" est de 96 matchs et 34 buts en championnat, des statistiques honorables pour ce milieu de terrain.
Le 9 juin 2004 il inscrit son 1er but avec l'équipe nationale lors des qualifications pour le mondial 2006 de la zone asiatique contre la Palestine. Il inscrira au total 3 buts lors de la 1ere phase de qualifications où l'Ouzbekistan terminera première de son groupe devant l'Irak notamment qui remportera quelques années plus tard la Coupe d'Asie des Nations. Lors du second tour des qualifications, celui qui determinera les 4 participants a la coupe du monde 2006, Djeparov ne réussit pas a emmener sa séléction au mondial, terminant 3e du groupe et butant notamment sur les sud coréens et les saoudiens.
En 2006 il dispute les qualifications de la Coupe d'Asie des Nations 2007, le trio offensif qu'il forme avec Shatskikh et Geynrikh envoie l'ouzbekistan disputer la coupe d'asie des nations qui se déroule en Indonésie, Malaysie, Thailande et Viet Nam. Server ne marquera aucun but dans cette competition mais contribuera a envoyer l'Ouzbekistan en quart de finale qui se fera éliminer par l'Arabie Saoudite, déjà bourreau des Ouzbeks lors de l'ultime phase de qualification pour la coupe du monde.
En 2008, le club du PFC Kuruvchi devenu le FC Bunyodkor Tachkent recrute celui qui deviendra le capitaine de la sélection Ouzbek. Son arrivée passera presque inaperçu a coté des coups de tonnerre médiatique réalisés par le club ouzbek, à savoir le recrutement du champion du monde Brésilien Rivaldo et de l'ancien selectionneur du Brésil et du Portugal, Luiz Felipe Scolari, qui deviendra par la même occasion, l'entraineur le mieux payé de la planète football.
L'effet est immédiat, le FC Bunyodkor remporte le championnat devant le Pakhatkor et la coupe en battant en finale après prolongation le Pakhtakor encore une fois. Server Djeparov termine meilleur buteur du championnat avec 19 buts au compteur, mais échouera en demi finale de l'AFC Champions League, éliminé par le club australien d'Adelaide United. Il sera tout de même élu joueur asiatique de l'année 2008.
L'année suivante, le Bunyodkor écrase le championnat ouzbek, réalisant presque un sans faute en remportant 28 victoires sur les 30 matchs de la saison, Server lui inscrira 11 buts seulement et terminant 7e au classement des meilleurs buteurs dominés par ses 2 collègues Rivaldo (20 buts) et Soliev (18 buts). En revanche le Bunyodkor perdra la finale de la coupe, le Pakhtakor prenant sa revanche en finale, mais ce qui marquera la saison c'est l'echec en quart de finale de l'AFC Champions League 2009 contre les sud coréens de Pohang Steelers, une défaite subit dans les prolongations du match retour alors que le Bunyodkor avait remporté le match aller 3 buts à 1. Les Pohang Steelers remporteront la Champions League quelques semaines plus tard.
En décembre 2008, après avoir été nommé Footballeur asiatique de l'année, il se voit offrir un mois d'essai avec le club de Chelsea en compagnie d'un autre joueur asiatique Ahmed Khalil l'attaquant d'Al Ahli. Rivaldo déclarera d'ailleurs à ce moment là que Djeparov a le niveau suffisant pour évoluer dans une des meilleures équipes d'Europe.
En 2008 et 2009 il dispute les qualifications pour la coupe du monde 2010, l'équipe nationale ouzbek s'étant fait un objectif de se qualifier pour la 1ere fois pour la coupe du monde qui se déroulera en 2010 en Afrique du Sud. Les Ouzbeks toujours emmenés par Djeparov et par l'étoile montante Fahrod Tadjiyev termineront même la 1ere phase de groupe devant l'Arabie Saoudite. La 2nde phase sera elle moins glorieuse pour l'Ouzbekistan, Djeparov et les siens termineront 5e du groupe B, ne réussissant pas a remporter le dernier match capital face au Bahrein, en effet une victoire leur aurait permis de se qualifier pour les barrages contre le 3e du groupe A qui n'était autre que l'Arabie Saoudite pour ensuite disputer l'ultime barrage contre la Nouvelle Zelande pour obtenir le billet envoyant l'équipe en Afrique du Sud... Ce n'est que partie remise.
Néanmoins l'objectif principal de Server sera d'emmené son club au sommet du continent asiatique en 2010 et de préparer la coupe d'Asie des Nations 2011 qui se déroulera au Qatar, les Ouzbeks étant déjà qualifiés depuis l'hiver 2009 remportant leurs 3 premiers matchs dont un but de Djeparov contre la Malaysie.
), mais il a de l'expérience, il a amené avec lui une grosse partie de son staff et tactiquement il a de grosses connaissances, ca ne peut qu'aider les joueurs qu'il dirige.
